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研究生: 茆玉麟
Mau, Yu-Lin
論文名稱: 不同平移調整項下二變量卜瓦松迴歸模型之研究
The analysis of bivariate Poisson regression model with varying offset
指導教授: 蘇佩芳
Su, Pei-Fang
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 管理學院 - 統計學系
Department of Statistics
論文出版年: 2016
畢業學年度: 104
語文別: 中文
論文頁數: 40
中文關鍵詞: 二變量卜瓦松分配平移調整項粒線體DNA
外文關鍵詞: Bivariate Poisson distribution, mitochondrion DNA, offset
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  • 想要探討化療對和粒線體DNA 上的突變個數是否有相關,我們所觀察的是母親和其後代身上粒線體DNA 的突變個數,因此屬於成對樣本,為了建立成對的計數型模型,我們利用二變量卜瓦松模型來解釋成對樣本之間的相關性。但是,因為所觀察到的粒線體DNA 長度不完整,以至於可能有部分的突變個數無法被觀察到,如果忽略此部分,會導致分析上會有偏誤。用來調整無法被觀察的部分的調整項,稱作平移調整項(offset)。然而,在傳統的二變量卜瓦松模型上對於這類的調整方式,是在每對成對樣本加上相同的平移調整項。在本文中,我們將推廣二變量卜瓦松分配,考慮的是每對樣本間所觀察的長度不同,因此是針對每對樣本間給予不同的平移調整項(varying offset),藉由此調整所估計出的參數估計偏誤會更,我們將以模擬的方式來證明此調整方式會比原本的更好。而在本文所分析的資料中,我們有興趣的是母親是否接受化療對於粒線體DNA 上的突變個數是否有相關。

    The goal of this research is to investigate the relationship between DNA and whether the chemo. To built the model for a paired count data, a bivariate Poisson regression is used to examine the relationship between samples taking account the paired correlation. However,
    if the length of the accessible genome is not complete, some mutation counts will not be observed. In such a case, the length of accessible genome, or we call offset term, vary within each pairs (e.g. mother and their offspring). The classical bivariate Poisson regression model treats the offset term as equal within pairs; thus, it cannot be applied directly. In this thesis, we propose an extended bivariate Poisson regression model with more general offset terms to adjust the length of the accessible genome for each observation. In application, we are interested in whether the mother received chemotherapy and the number of mutations in mitochondrial DNA is relevant.

    摘要 i 英文延伸摘要 ii 誌謝 vii 目錄 viii 表目錄 ix 圖目錄 x 第一章 緒論 1 第一節 資料背景. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 第二節 資料介紹. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 第三節 研究目的. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 第二章 文獻回顧 3 第一節 二變量卜瓦松分配(Bivariate Poisson distribution) . . . . . . . . . . . 3 第二節 概似函數. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 第三節 二變量卜瓦松迴歸(Bivariate Poisson regression) . . . . . . . . . . . 6 第三章 研究方法 8 第一節 二變量卜瓦松分配具平移調整項. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 第二節 二變量卜瓦松迴歸具平移調整項. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 第四章 模擬 13 第一節 二變量卜瓦松機率分配. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 第二節 二變量卜瓦松迴歸. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 第五章 資料分析 20 第六章 結論 23 參考文獻 24 附錄A 25 附錄一 修正後的遞推關係. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 附錄二 EM 演算法的E-step . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 附錄三 證明BP 模型和BPO 模型的比較. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32

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    無法下載圖示 校內:2019-06-23公開
    校外:不公開
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