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研究生: 林佑儒
Lin, Yu-Ju
論文名稱: 修正HELANAL判別蛋白質線型與曲型螺旋體特徵之方法
Correction to protein Helix characterization of HELANAL - F test for Linear and Curved Hypothesis
指導教授: 王清正
Wang, Ching-Cheng
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 電機資訊學院 - 製造工程研究所
Institute of Manufacturing Engineering
論文出版年: 2004
畢業學年度: 92
語文別: 中文
論文頁數: 29
中文關鍵詞: 蛋白質、螺旋體二級結構、幾何特徵、最小平方法
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  • 本論文將蛋白質螺旋體二級結構的定義與分類做完整的回顧後,進一步研讀採用統計方法中之迴歸分析(Regression Analysis)來判別螺旋體二級結構之線性相關(Linear Correlation)與非線性相關(Non-linear Correlation)的幾何特徵。現有的HELANAL方法應用最小平方法(Least Square Method)來做演算分析,並據以判讀螺旋體之幾何特徵。本文之貢獻在於改善HELANAL方法,藉由F分配檢定,來做精確客觀的判讀分析,提高判讀結果的統計準確性。

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    中文摘要 I 誌謝 II 目錄 III 圖目錄 IV 表目錄 V第一章 緒論 1 1.1 研究動機…………………………………………………………1 1.2 研究目的…………………………………………………………1 1.3 研究背景…………………………………………………………2 第二章 文獻探討 4 2.1 蛋白質的二級結構………………………………………………4 2.2 蛋白質結構分析流程……………………………………………5 第三章 蛋白質的功能與螺旋體二級結構之型式 6 3.1 幾何結構…………………………………………………………6 3.2 氫鍵結構…………………………………………………………9 3.2.1 氫鍵是組成各種二級構造的重要鍵結力量…………………9 3.2.2 氫鍵之性質……………………………………………………9 3.2.3 氫鍵的基礎型式………………………………………………10 3.2.4 聚合之氫鍵型式………………………………………………12 3.3 螺旋體二級結構之型式…………………………………………14 第四章 螺旋體之幾何特徵判讀與其改善 20 4.1 HELANL …………………………………………………………20 4.2 線型方根之差與曲型方根之差…………………………………21 4.2.1 線性迴歸模型的應用………………………………………21 4.2.2 樣本迴歸模型………………………………………………22 4.2.3 線性迴歸模型的性質………………………………………24 4.3 α-螺旋體之幾何型式……………………………………………24 4.4 F分配的意義、用途與性質………………………………………25 4.4.1 F分配………………………………………………………25 4.4.2 F分配的性質………………………………………………26 第五章 貢獻與結論 28 參考文獻 29

    一、中文部分
    1.方廷堯,民國90,“以蛋白質初級結構做二級結構之電腦輔助預測-所需結構分類”國立成功大學碩士學位論文。
    2.林惠玲、陳正倉,1996,“統計學方法與應用”,雙葉書廊。
    3.陳明造、葉東柏,1987,“基礎生物化學”,藝軒圖書出版社。
    4.程崇道,1971,“生物化學”,正中書局。
    5.張素梅,1997,“統計學”,三民書局。
    6.顏月珠,1985,“商用統計學”,三民書局。
    7.魏正舒、趙清貴,1992,“生物化學”,和記圖書出版社。
    二、英文部分
    1. Bansal, M., Kumar, S., and Velavan, R., 2000,“HELANAL:A Program to Characterize Helix Geometry in Proteins,” Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, Vol. 17, No. 5, pp. 811-819.

    下載圖示 校內:2009-07-29公開
    校外:2009-07-29公開
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