加值型營業稅係以「進項稅額扣抵法」，計算營業人當期之應納或溢付稅額。營業人以進項稅額扣抵銷項稅額，須取得合法進項憑證作為前提要件，否則不准扣抵。又營業人涉犯逃漏稅，於計算漏稅額時，亦同樣不准未取得合法進項憑證者扣抵銷項稅額。然實務上，卻有營業人於進貨時無法取得法定進項憑證之情形，倘若皆不准其於本稅及漏稅額部分扣除進項稅額，將使此類型之營業人面臨鉅額的營業稅及漏稅罰。
目前立法上除二手車買賣，以及財政部制定之「廢棄物運銷合作社代開發票」函釋外，並無其他針對此情形之對應規範。實務上普遍認為，應採嚴格的憑證主義，不許未履行法定憑證義務者申報進項稅額扣抵，且在計算漏稅額時，亦不允許其扣除該未依規定取得並申報之進項稅額。學說上則認為，納稅義務人違反稅法上協力義務，應僅生稽徵機關得進行推計課稅之法律效果，不應使營業人就此喪失進項稅額扣抵權利，而對於所漏稅額之認定，則在看法上產生可否推計之意見分歧。
本文於綜觀學說、實務見解後，乃針對營業稅相關規範進行基本權合憲性檢驗。並於得出違憲結論後，從納稅者權利保護觀點，認為得透過推計方式解決系爭問題。最後，援引日本消費稅之簡易課稅制度，作為往後營業稅修法之借鏡。

The value-added business tax is calculated using the "input tax deduction method" to determine the amount of tax payable. Input tax deduction is not allowed if the business entity does not obtain input documentary evidence. In addition, when calculating the amount of tax leakage, it is not allowed to deduct input tax without obtaining input documentary evidence. However, in practice, there are cases where a business entity is unable to obtain input documentary evidence at the time of purchase. If it is not allowed to deduct the input tax from both the amount of tax payable and tax leakage, this will result in a large amount of business tax and the punishment of tax evasion.
Currently, there are no other regulations on this issue. In practice, it is widely believed that those who don't obtain input documentary evidence should not be allowed to claim input tax deduction or deduct input tax when calculating tax leakage amount. Academics argue that the violation of the taxpayer's cooperation obligation should only allow for tax estimation, with different views on the estimation of tax leakage amount.
This paper summarizes academic and practical views and examines the constitutionality of the fundamental rights within the relevant business tax regulations. Concluding that they are unconstitutional, it argues that the controversial issue can be resolved through tax estimation while considering the perspective of protecting taxpayers' rights. Finally, it cites the simplified taxation system of Japan's consumption tax as a model for future amendments to Taiwan's Business Tax Act.

壹、中文文獻
一、專書
1. 于宗先、王金利，台灣賦稅體制之演變，聯經，2008年5月。
2. 李惠宗，稅法方法論，元照，2021年9月。
3. 李惠宗，憲法要義，元照，2019年9月，8版。
4. 許育典，憲法，元照，2020年9月，10版。
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7. 陳清秀，稅法各論（上），元照，2021年10月，4版。
8. 陳清秀，稅法基礎案例研習，新學林，2016年8月。
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12. 黃源浩，租稅法，五南，2020年9月。
二、論文集
1. 黃士洲，稅務訴訟證明程度之減輕，收於：氏著，稅務訴訟的舉證責任，翰蘆，2002年8月，頁182-256。
三、專書論文
1. 陳清秀，營業稅（上），收於：黃茂榮、葛克昌、陳清秀主編，稅法各論，新學林，2019年6月，2版。
2. 黃士洲，論進項稅額扣抵的形式要件與規範實質—最高行政法院96年度判字第1403號判例評析，收於：行政訴訟制度相關論文彙編第6輯，司法院，2009年12月，頁507-542。
3. 黃源浩，營業稅（下），收於：黃茂榮、葛克昌、陳清秀主編，稅法各論，新學林，2019年6月，2版。
四、譯著
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五、期刊論文
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10. 柯格鐘，合作店營業稅之爭議(下)—評大法官釋字第六八五號解釋，月旦法學雜誌，194期，2011年7月，頁144-165。
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12. 柯格鐘，論比例原則在稅法規範違憲審查中的作用──以稅捐債務法規範為探討中心，興大法學，26期，2019年11月，頁93-152。
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41. 葛克昌，稅捐罰與憲法解釋，月旦法學雜誌，202期，2012年3月，頁114-139。
42. 劉建宏，當事人協力義務與稅捐稽徵機關舉證責任之衡平，當代財政，17期，2012年5月，頁28-38。
43. 鍾芳樺，租稅正義與一貫性原則：論 Tipke 租稅正義理論及其對稅捐法律的標準，國立臺灣大學法學論叢，47卷1期，2018年3月，頁1-61。
六、學位論文
1. 李淑鈴，進項稅額不得扣抵與衍生問題探討，國立成功大學法律學系碩士論文，2013年7月。
2. 陳泓逸，加值型營業稅中進項稅額扣抵權與非實際交易對象認定之研究—以資源回收物運銷合作社為檢討適例，東吳大學法學院法律學系碩士論文，2022年6月。
3. 曾正安，論營業稅之進項稅額扣抵權，國立中正大學財經法律系研究所碩士論文，2016年1月。
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貳、外文文獻
一、書籍
1. （美）艾伦．申克、（美）维克多．瑟仁伊、（美）崔威着，熊伟、任宛立译，增值税比较研究，商务印书馆，2018年6月。
2. 水野忠恒，テキストブック租税法，中央経済社，2016年4月。
3. 金子宏，租税法，弘文堂，2021年，24版。
4. 金井肇，中小事業者と消費税，收於：消費税の研究(日税研論集VOL70)，日本税務研究センター，2017年1月。
5. 藤枝純、遠藤努，消費税法の実務詳解，中央経済社，2021年3月。
二、期刊
1. COUNCIL DIRECTIVE 2006/112/EC of 28 November 2006 on the common system of value added tax, Official Journal of the European Union, L347, 11.12.2006, pp.1-118.
三、網路資源
1. 国税庁，消費税の軽減税率制度，https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/shohi/6102.htm，（最後瀏覽日期：2023年6月30日）。