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研究生: 許書韋
Hsu, Shu-Wei
論文名稱: 蛋白質資料庫(PDB)中結構穩定的螺旋體序列之統計分析
Statistical Analysis for Stable Helical Sequence Segments in PDB
指導教授: 王清正
Wang, Ching-Cheng
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 電機資訊學院 - 製造工程研究所
Institute of Manufacturing Engineering
論文出版年: 2005
畢業學年度: 93
語文別: 中文
論文頁數: 27
中文關鍵詞: 蛋白質二級結構電腦協助資料庫預測
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  •   蛋白質的三維結構決定其生理功能,然而決定立體結構的實驗曠日費時,故預測方法遂成為決定立體結構之重要輔助工具之ㄧ,蛋白質二級結構的預測通常被認爲是蛋白質立體結構預測的基礎,本研究將集中焦點於二級結構中的螺旋體序列。
      現有二級結構之預測方法偏重於電腦運用的複雜演算法(基因演算法、類神經網路等),並且對所有的胺基酸序列片段預測判斷,因此易造成預測方法精準度不佳且可信度不高。鑑此,本研究利用現存螺旋體資料庫進一步分析,彙整出結構穩定螺旋體的patterns、建構胺基酸特性分類函式及整理一些螺旋體特性,期望能提供使用者作為輔助預測判斷之用。我們避免了運用複雜的運算過程而得到的結果,而是用結構穩定的螺旋體做為分析運用,目的是希望能以較簡單預測的螺旋體序列,減少預測分析時的複雜度。

    摘 要 I 致 謝 II 目 錄 III 表 目 錄 IV 圖 目 錄 IV 第一章 緒論 1 1.1 研究動機 1 1.2 重要性 1 1.3 研究背景 2 1.4 研究目的 3 第二章 文獻探討 5 2.1 模組(Motif) 5 2.2 胺基酸特性 7 第三章 輔助預測系統 9 3.1 建立helix pattern資料表 9 3.2 胺基酸特性分類函式 13 3.3 螺旋體特性(Helix Propensity) 18 3.3.1 胺基酸其為螺旋體殘基(helical residue)的比例 18 3.3.2 單位長度螺旋體序列個數 21 3.4 輔助能量計算 24 第四章 結論與未來展望 27 參考文獻 28 自 述 29

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    下載圖示 校內:立即公開
    校外:2005-09-08公開
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