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研究生: 鍾駿豪
Chung, Chun-Hao
論文名稱: 人類染色體的相關性結構分析
A Study of Statistical Correlation Structure in Human Chromosomes
指導教授: 楊緒濃
Nyeo, Su-Long
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 理學院 - 物理學系
Department of Physics
論文出版年: 2005
畢業學年度: 93
語文別: 中文
論文頁數: 42
中文關鍵詞: 相關性染色體
外文關鍵詞: DNA, correlation
相關次數: 點閱:50下載:1
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  •   人類基因體是由非常龐大的DNA序列所構成,在這30億
    個鹼基對中卻僅有約1% 的部份可轉錄成mRNA再轉譯為
    蛋白質,剩下99%的部份乍看之下似乎沒有用的序列,
    但其中卻可能隱含著未知的訊息,本文中藉由相關性
    結構的分析,可以看見生物序列間存在著相關性結構
    ,且其相關性大多依循尺度的增加而隨著幕次衰減或
    指數衰減,存在著尺度不變的特性,在原核生物中在
    尺度大於103後相關性就急速衰減,而真核生物則有長
    距離相關性,其中人類跟老鼠在尺度為106的地方相關
    性依舊很高,而較低等的真核生物果蠅與阿拉伯芥則
    低了許多,這個結果可能與GC密集區域有關,此外在
    人類序列中可看見在SW法則下,Alu重複序列對相關性
    產生顯著影響,而RY與KM法則下無法顯著看到此現象。

    none

    摘要.............................I 致謝............................II 目錄...........................III 表目錄..........................IV 圖目錄...........................V 1. 前言..........................1   1.1. DNA結構.................1   1.2. 重複序列................2   1.3. 生物資訊................2 2. 數學方法......................4   2.1. 方法....................4   2.2. 核苷酸配對..............5   2.3. 資料來源................7 3. 數據分析與討論................8   3.1. 隨機序列................8   3.2. 原核生物................9   3.3. 真核生物...............11   3.4. 人類序列...............13   3.4.1. SW法則...............13   3.4.2. RY法則...............25   3.4.3. KM法則...............26 4. 結論.........................27 參考文獻........................29 附錄A:人類染色體相關性結構表...30 附錄B:程式碼...................33

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    下載圖示 校內:立即公開
    校外:2005-07-08公開
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